Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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