Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PUM3Q15397 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms