Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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