Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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