Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms