Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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FOXE3Q13461 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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FOXE3Q13461 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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FOXE3Q13461 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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FOXE3Q13461 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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