Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms