Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ATRXP46100 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ATRXP46100 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATRXP46100 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATRXP46100 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ATRXP46100 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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