Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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PTPRMP28827 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
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PTPRMP28827 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
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PTPRMP28827 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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PTPRMP28827 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRMP28827 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRMP28827 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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