Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HOXD10P28358 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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HOXD10P28358 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HOXD10P28358 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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