Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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