Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms