Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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