Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms