Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms