Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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