Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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