Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SSPNQ14714 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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