Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
GTF2H3Q13889 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
GTF2H3Q13889 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms