Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGA9Q13797 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms