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| ITGA9 | Q13797 | PARD3-204 | ENST00000374768 | 799 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | SNORD65C-201 | ENST00000390962 | 71 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
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| ITGA9 | Q13797 | FAM111B-202 | ENST00000411426 | 3344 nt | TSL 4 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | PNPT1P2-201 | ENST00000456768 | 2050 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | ADGRL4-201 | ENST00000370742 | 3527 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | EED-206 | ENST00000527888 | 1422 nt | TSL 2 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | EVI5-208 | ENST00000540033 | 7436 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | MCF2-201 | ENST00000338585 | 2826 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | SPINK1-201 | ENST00000296695 | 542 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | OR4P4-201 | ENST00000314612 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| ITGA9 | Q13797 | AC021713.1-201 | ENST00000526554 | 510 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| ITGA9 | Q13797 | AL163973.2-201 | ENST00000548096 | 288 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AL133166.1-202 | ENST00000550975 | 565 nt | TSL 4 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AF123462.1-201 | ENST00000554307 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AC012170.3-201 | ENST00000560159 | 297 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AC138907.2-201 | ENST00000561479 | 866 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AC145350.4-201 | ENST00000562827 | 866 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| ITGA9 | Q13797 | LINC01584-202 | ENST00000563990 | 852 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AL132657.2-201 | ENST00000564417 | 358 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| ITGA9 | Q13797 | AC069366.1-201 | ENST00000583159 | 838 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AC011524.1-201 | ENST00000590167 | 240 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AL034351.1-201 | ENST00000605288 | 668 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AL022238.2-202 | ENST00000607915 | 658 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | U7.8-201 | ENST00000619968 | 63 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AC016717.3-201 | ENST00000624730 | 554 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AC010608.2-201 | ENST00000624830 | 470 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | SUCLA2P2-201 | ENST00000417269 | 1309 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AC104446.1-201 | ENST00000613728 | 1321 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | AC009229.4-201 | ENST00000623854 | 1947 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | CFHR3-205 | ENST00000471440 | 1965 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | KCNJ16-201 | ENST00000283936 | 4062 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | ZNF616-201 | ENST00000330123 | 2563 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | CYP3A7-CYP3A51P-201 | ENST00000611620 | 1608 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | CCDC102B-201 | ENST00000360242 | 2711 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | RFX7-201 | ENST00000559447 | 10426 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | MUC19-205 | ENST00000454784 | 24775 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | RAG2-201 | ENST00000311485 | 2388 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | CCNH-206 | ENST00000508855 | 2391 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | SYNE1-207 | ENST00000367255 | 27748 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | LCA5L-201 | ENST00000288350 | 2416 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| ITGA9 | Q13797 | DEFB129-201 | ENST00000246105 | 698 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |