Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TCIRG1Q13488 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms