Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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