Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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GPS1Q13098 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GPS1Q13098 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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