Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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