Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ERVV-1B6SEH8 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms