Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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