Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms