Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms