Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SP6Q3SY56 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms