Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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