Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms