Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms