Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTCH1Q13635 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTCH1Q13635 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTCH1Q13635 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTCH1Q13635 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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