Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL3Q13618 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms