Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TCOF1Q13428 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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TCOF1Q13428 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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TCOF1Q13428 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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TCOF1Q13428 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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TCOF1Q13428 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCOF1Q13428 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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