Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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TRAF1Q13077 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAF1Q13077 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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