Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTP4A2Q12974 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTP4A2Q12974 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTP4A2Q12974 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTP4A2Q12974 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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