Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms