Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms