Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms