Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRIP13Q15645 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRIP13Q15645 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms