Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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