Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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