| RUNX2 | Q13950 | PLAG1-201 | ENST00000316981 | 7322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRL2-205 | ENST00000370717 | 5873 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z98755.1-201 | ENST00000407015 | 1384 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAP1B-201 | ENST00000250559 | 13438 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KLF12-201 | ENST00000377669 | 10637 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR2L5-201 | ENST00000355281 | 2429 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR56A3-205 | ENST00000641905 | 4595 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NAIP-210 | ENST00000523981 | 4543 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NFIB-211 | ENST00000606230 | 2311 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5F1-201 | ENST00000278409 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HIST1H2BD-201 | ENST00000289316 | 789 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C1orf100-201 | ENST00000308105 | 579 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-931P-201 | ENST00000363850 | 107 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1243P-201 | ENST00000364028 | 107 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-657P-201 | ENST00000383904 | 107 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-441P-201 | ENST00000384545 | 106 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM26D-203 | ENST00000405399 | 1165 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX41-202 | ENST00000414256 | 604 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009518.2-201 | ENST00000418056 | 731 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006369.2-201 | ENST00000431712 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445567.1-201 | ENST00000439121 | 144 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00456-201 | ENST00000453862 | 692 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL109741.2-201 | ENST00000455561 | 343 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01150-201 | ENST00000455671 | 315 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL606519.1-201 | ENST00000458146 | 580 nt | TSL 2 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANK3-207 | ENST00000460468 | 677 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P16-201 | ENST00000465177 | 898 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P22-201 | ENST00000472363 | 168 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087879.1-201 | ENST00000474343 | 374 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC70-203 | ENST00000491184 | 703 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS4XP18-201 | ENST00000495480 | 763 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092924.1-201 | ENST00000496084 | 487 nt | TSL 4 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARL4AP1-201 | ENST00000503220 | 705 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025741.1-201 | ENST00000506100 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ERAP2-205 | ENST00000510309 | 1275 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005699.1-205 | ENST00000510639 | 427 nt | TSL 2 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010486.3-201 | ENST00000511602 | 785 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP46-201 | ENST00000515942 | 234 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP446-201 | ENST00000515955 | 82 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY4P37-201 | ENST00000516225 | 96 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTK2-220 | ENST00000520151 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108863.1-201 | ENST00000520863 | 650 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTH-202 | ENST00000529816 | 799 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | REXO2-218 | ENST00000544827 | 880 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL389895.1-201 | ENST00000554127 | 252 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC135628.1-201 | ENST00000568867 | 534 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AJ003147.1-201 | ENST00000576762 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD39.3-201 | ENST00000584451 | 71 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4999-201 | ENST00000585029 | 91 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC106791.2-201 | ENST00000604680 | 391 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099566.1-205 | ENST00000609411 | 657 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL392048.1-201 | ENST00000613946 | 534 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | uc_338.18-201 | ENST00000615451 | 175 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090246.1-201 | ENST00000616499 | 426 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL049536.1-201 | ENST00000625043 | 744 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTN-AS1-267 | ENST00000628826 | 662 nt | TSL 5 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK10-235 | ENST00000638225 | 8941 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z73965.1-201 | ENST00000623412 | 2297 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004803.1-201 | ENST00000503602 | 3207 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CP-201 | ENST00000264613 | 4676 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP7A-201 | ENST00000341514 | 8483 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR2H1-203 | ENST00000377136 | 3024 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC117529.2-201 | ENST00000512159 | 2068 nt | BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WDR7-201 | ENST00000254442 | 14083 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EMSY-207 | ENST00000525919 | 4074 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.31 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C15orf41-212 | ENST00000567389 | 2618 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LUZP2-207 | ENST00000533227 | 5016 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092821.1-201 | ENST00000640129 | 4180 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAP3K20-202 | ENST00000375213 | 3741 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC125257.1-201 | ENST00000560400 | 2930 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF285-205 | ENST00000614994 | 6012 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCDH11X-204 | ENST00000373088 | 4069 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK10-286 | ENST00000641208 | 8747 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ETV1-205 | ENST00000405192 | 4402 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PNISR-201 | ENST00000369239 | 5112 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL122126.1-201 | ENST00000546905 | 1318 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR4F6-201 | ENST00000328882 | 1238 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-2-201 | ENST00000384274 | 95 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-6-201 | ENST00000384711 | 96 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ35-201 | ENST00000390502 | 59 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAF9BP1-201 | ENST00000396646 | 746 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GLULP6-201 | ENST00000399502 | 913 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | STON1-GTF2A1L-204 | ENST00000405008 | 3821 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.625-201 | ENST00000411256 | 107 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01934-201 | ENST00000414750 | 391 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005062.1-204 | ENST00000415499 | 743 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL26P29-201 | ENST00000415623 | 438 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC119751.6-201 | ENST00000416712 | 186 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098592.1-201 | ENST00000419352 | 333 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL390962.1-201 | ENST00000421507 | 526 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01318-201 | ENST00000423593 | 597 nt | TSL 4 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR4F13P-201 | ENST00000428478 | 931 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008065.1-201 | ENST00000428525 | 348 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL133268.3-201 | ENST00000428903 | 577 nt | TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138878.2-201 | ENST00000440581 | 1241 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARL2BPP10-201 | ENST00000446487 | 531 nt | BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104781.1-201 | ENST00000449838 | 397 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01645-201 | ENST00000451341 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354771.1-201 | ENST00000452178 | 602 nt | TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCE1-AS2-205 | ENST00000453183 | 427 nt | TSL 5 BASIC | 4.3 | □□□□□ -1.72 | | |