Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RUNX2Q13950 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms