Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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DDX39BQ13838 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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DDX39BQ13838 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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DDX39BQ13838 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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DDX39BQ13838 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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DDX39BQ13838 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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DDX39BQ13838 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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