Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FHL3Q13643 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms