Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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