Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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