Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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