Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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GRIK2Q13002 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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GRIK2Q13002 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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GRIK2Q13002 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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